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醫學上，微牙齒種植體也可以根據醫治必須植于口腔內部的不同位置。嵌入前，栽種醫生解決嵌入區解剖學特性十分明確。依據嵌入區域的特性（如局部解剖、骨質密度、牙龈間隔、皮下組織狀況）和負荷的形式，微牙齒種植體具有不同孔徑、長短與頭頂部種類。
微牙齒種植體的直徑一般少于1.9mm，同牙齒種植體手術室器械及牙齒種植體的挑選標准一樣，裂鑽的直徑應略低于微牙齒種植體孔徑（如低于0.2～0.3mm），以獲得種植體表層與骨皮質的優良嵌合體，提升微牙齒種植體初期可靠性。
依照孔徑與尺寸歸類
微牙齒種植體的長度爲5～10mm，孔徑範圍在1.2～2.0mm左右，可以根據嵌入區域內的骨皮質厚度、超聲骨密度、相鄰極爲重要的解剖位置等因素實際挑選。
一般，根空隙比較大時可挑選孔徑較粗一點微牙齒種植體，在防止離斷上颌骨、窦腔、下颌神經管等關鍵局部解剖的情形下，門牙區可以選擇比較長的長短，後槽牙區域種植體長短相對較短。
依照嵌入方法歸類
並不是開展翻瓣或牙床環切的情形下立即手動式旋緊的钛金屬或孔徑不低于1.5mm的钛合金微牙齒種植體。其頂尖與外螺紋的利刃較爲銳利，比較容易提升皮質骨，操作中需要注意勿傷到口腔內部粘膜及嵌入區鄰牙牙齒的牙龈。
自攻進型牙齒種植體是醫學上常采用種植體種類，主要運用于皮質骨高密度水平不太高時，需要扭距爲7～8N•cm。直徑爲低于1.5mm的钛金屬微牙齒種植體也能夠承受一定的自攻能量，但較細钛合金微牙齒種植體（直徑爲低于1.5mm）則很容易斷裂。
當骨皮質超聲骨密度十分高密度，立即手動式旋緊方法存在一定的困境時，應先利用手機鑽針預成就位道，再沿就位道方向嵌入微牙齒種植體。一般用于偏細或钛合金微牙齒種植體。
前期根據裂鑽協助預成就位道，待覺得骨摩擦阻力忽然減少時改成手動式攻進的聯合嵌入方法。
依照頭部形態歸類
按微牙齒種植體頭部形態可以分爲沒頭型與有頭形。其中還有頭形也包括小頭形、圓口型、長頭形、固定不動型、托糟型等。
依照粘膜對外開放或關閉的形式歸類
依據粘膜薄厚明確微牙齒種植體頭頂部坐落于埋于粘膜下或是曝露粘膜上邊，即封閉型或敞開式。一般來說，閉合理合法所選用的微牙齒種植體比對外開放發送1～2mm。
依據粘膜的特性選擇是否應該做切口，如附著龈的寬度較大時，可防止切口立即攻進微牙齒種植體，如果以遊離龈爲主體的皮下組織地區，就選擇手術治療割開或是牙床環切的形式曝露術區，再次植入入微牙齒種植體。
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